Dane strukturalne na temat kontroli cyklu komórkowego przez niezbędną GTPazę Era

Abstrakt

Białko Era (ang. Escherichia coli Ras-like protein), niezbędne dla funkcjonowania komórki bakteryjnej, składa się z N-końcowej domeny o aktywności GTPazy oraz C-końcowej domeny KH. W komórce bakteryjnej białko to uczestniczy w modyfikacji rybosomalnego RNA (rRNA) 16S oraz dojrzewaniu podjednostki 30S (małej) rybosomu. Era rozpoznaje sekwencję 10 nukleotydów (₁₅₃₀GAUCACCUCC₁₅₃₉) w pobliżu końca 3â rRNA 16S i oddziałuje z helisą 45 (h45, nukleotydy 1506-1529). Związanie GTP umożliwia związanie przez białko Era cząsteczki RNA, co zwiększa jego aktywność hydrolizy GTP. W wyniku hydrolizy GTP białko Era zostaje z kolei uwolnione od dojrzałej podjednostki 30S rybosomu. W ten sposób Era kontroluje szybkość wzrostu komórki poprzez regulację dojrzewania podjednostek 30S rybosomów. Jak wiadomo, rybosomy są miejscem produkcji białek w każdej komórce. Sekwencja GAUCA i struktura h45 są zachowane w ewolucji we wszystkich trzech królestwach organizmów żywych. Homologi białka Era wykryto również w komórkach eukariotycznych. Z tego względu zrozumienie mechanizmu działania bakteryjnego białka Era dostarcza ważnych wskazówek dotyczących kontroli cyklu komórkowego także w komórkach Eukaryota.