Metody spektrometrii mas oparte o dane (DDA) oraz metody niezależne od danych (DIA) wykorzystywane w analizie materiału biologicznego

Abstrakt

Spektrometria mas jest nieocenionym narzędziem w analizie proteomicznej, metabolomicznej i lipidomicznej. Dla pełnego wykorzystania jej potencjału, kluczowym jest wybranie i skonfigurowanie odpowiedniego podejścia analitycznego. W przypadku badań niecelowanych dostępne są dwie główne strategie: analiza zależna od danych (DDA) oraz analiza niezależna od danych (DIA). Obie metody różnią się sposobem przeprowadzenia analizy i stopniem pokrycia uzyskanych danych, dlatego każda z nich może znaleźć zastosowanie w różnych typach badań. Metoda DDA opiera się na bieżącym skanowaniu analizowanych jonów, w efekcie czego prekursory o najwyższej intensywności poddawane są fragmentacji. Z kolei technika DIA, dzięki zastosowaniu łączonych zakresów izolacji jonów prekursorowych, pozwala na głębszą analizę badanych związków. Oba podejścia można modyfikować usprawniając ich działanie i umożliwiając uzyskanie większej ilości danych. Na horyzoncie pojawiają się także metody łączące obie techniki, jak np. DDIA, która wykorzystuje zalety obu tych metod otwierając nowe możliwości analityczne.