Profilowanie rybosomów jako innowacyjne narzędzie do badania procesu syntezy białek
DOI:
https://doi.org/10.18388/pb.2019_255Abstrakt
Technika profilowania rybosomów (Ribo-seq) jest obecnie najefektywniejszą metodą badania procesu syntezy białek w warunkach in vivo. Ribo-seq polega na sekwencjonowaniu fragmentów mRNA ochranianych przez rybosomy (tzw. odcisków rybosomów), co pozwala na określenie dokładnej pozycji rybosomów na transkryptach. Zaawansowana analiza bioinformatyczna danych uzyskanych z sekwencjonowania umożliwia selekcję odcisków rybosomów pochodzących od translatujących rybosomów, dając informację o rzeczywistym statusie translacyjnym mRNA. Celem artykułu jest zapoznanie czytelników z metodą profilowania rybosomów oraz podstawowymi strategiami eksperymentalnymi i bioinformatycznymi, istotnymi w uzyskaniu satysfakcjonujących rezultatów. Ponadto artykuł przedstawia konkretne przykłady zastosowania techniki profilowania rybosomów w różnych systemach biologicznych, dając znaczący wgląd w proces translacji i jego regulację.