Prymazy prokariotyczne – budowa i funkcje

Abstrakt

Prymazy odpowiadają za syntezę krótkich oligo RNA, które służą jako startery do syntezy prowadzonej przez polimerazy DNA. Prymazy odgrywają kluczową rolę w inicjacji syntezy nici DNA w miejscach początku replikacji (ang. replication origin), syntezie fragmentów Okazaki oraz ponownym uruchomieniu zatrzymanych widełek replikacyjnych. Prokariotyczne prymazy na podstawie budowy i porównania sekwencji aminokwasowych zaliczane są do rodziny białek DnaG. Prymazy należące do tej rodziny posiadają trzy odrębne domeny. Na N-końcu znajduje się domena wiążąca cynk odpowiedzialna za wiązanie matrycowego DNA. Środkowa domena odpowiedzialna jest za aktywność polimerazy RNA natomiast C-końcowa domena posiada aktywność helikazy lub odpowiada za oddziaływanie z helikazą. Poniżej przedstawiamy porównanie mechanizmu działania prymaz rodziny DnaG, a także ich udział w syntezie DNA w widełkach replikacyjnych.