Wprowadzenie młodego człowieka do PDB

Abstrakt

Bank Struktur Białkowych (Protein Data Bank, PDB), utworzony w 1971, gdy znano zaledwie 7 struktur białek, dziś zawiera ponad 120 tys. wyznaczonych doświadczalnie trójwymiarowych modeli makromolekuł biologicznych, w tym takich gigantów jak wirusy i rybosomy złożone z setek tysięcy atomów. Większość zdeponowanych w PDB struktur pochodzi z krystalografii rentgenowskiej, choć z postępem metodologii swój udział zaznaczyła spektroskopia NMR oraz â obecnie â kriomikroskopia elektronowa. Mimo że wyznaczanie struktury makromolekuł zostało z czasem ułatwione przez niewyobrażalny postęp techniki i metod obliczeniowych, jest ono nadal skomplikowanym procesem badawczym, wymagającym solidnego wyszkolenia, doświadczenia i talentu. Podobnie zrozumienie astronomicznej ilości danych zgromadzonych w PDB i przełożenie ich na wiedzę â wymaga dobrego przygotowania. Wstępem do niego może być niniejszy artykuł.