Wprowadzenie młodego człowieka do PDB

Autor

  • Wladek Minor Department of Molecular Physiology and Biological Physics, University of Virginia, Charlottesville
  • Zbigniew Dauter Macromolecular Crystallography Laboratory, National Cancer Institute, Argonne National Laboratory, Argonne
  • Mariusz Jaskolski 3 Department of Crystallography, Faculty of Chemistry, A. Mickiewicz University, Poznan; Center for Biocrystallographic Research, Institute of Bioorganic Chemistry, Polish Academy of Sciences, Poznan

DOI:

https://doi.org/10.18388/pb.2016_1

Abstrakt

Bank Struktur Białkowych (Protein Data Bank, PDB), utworzony w 1971, gdy znano zaledwie 7 struktur białek, dziś zawiera ponad 120 tys. wyznaczonych doświadczalnie trójwymiarowych modeli makromolekuł biologicznych, w tym takich gigantów jak wirusy i rybosomy złożone z setek tysięcy atomów. Większość zdeponowanych w PDB struktur pochodzi z krystalografii rentgenowskiej, choć z postępem metodologii swój udział zaznaczyła spektroskopia NMR oraz â obecnie â kriomikroskopia elektronowa. Mimo że wyznaczanie struktury makromolekuł zostało z czasem ułatwione przez niewyobrażalny postęp techniki i metod obliczeniowych, jest ono nadal skomplikowanym procesem badawczym, wymagającym solidnego wyszkolenia, doświadczenia i talentu. Podobnie zrozumienie astronomicznej ilości danych zgromadzonych w PDB i przełożenie ich na wiedzę â wymaga dobrego przygotowania. Wstępem do niego może być niniejszy artykuł.

Pobrania

Statystyki pobrań niedostępne.

Opublikowane

2016-11-18